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Honorarios médicos: cómo facturar, IVA y retenciones

Recibo de honorarios médicos hoy es una factura: por qué la consulta va exenta de IVA, cuánto retiene una empresa o aseguradora y cómo deduce el paciente.

Por L.C. Alberto Ramón García, Director · Cédula profesional 2581569 · LinkedIn

Publicado el

Lectura de 5 min

En este artículo
  1. Por qué la consulta médica no lleva IVA
  2. Qué lleva tu factura de honorarios médicos
  3. Un mes de una médica, resuelto con números
  4. Lo que necesita tu paciente para deducir tu consulta
  5. Por qué la contabilidad de un médico es distinta

El recibo de honorarios médicos hoy es una factura electrónica (CFDI) de ingreso que el médico emite por cada consulta o servicio cobrado. Si la consulta la da una persona física con título de médico, va exenta de IVA (Ley del IVA, art. 15, fr. XIV); si se la cobras a una empresa o aseguradora, te retiene ISR: el 10 % si estás en el régimen 612 o el 1.25 % si estás en RESICO (Ley del ISR, arts. 106 y 113-J).

Abajo, lo que lleva la factura, un mes de una médica resuelto con números y qué necesita tu paciente para deducir tu consulta.

Por qué la consulta médica no lleva IVA

La Ley del IVA exenta los servicios profesionales de medicina cuando su prestación requiere título de médico y los presta una persona física, por su cuenta o a través de una sociedad civil (art. 15, fr. XIV). En la factura, el IVA va como exento, no al 16 %.

Dos matices que conviene tener claros:

  • No todo lo que cobras es consulta. Las medicinas de patente que vendes por separado van a tasa 0 %; el medicamento que se da como parte de un servicio de hospital causa el 16 % (Ley del IVA, art. 2-A; criterio normativo 9/IVA/N del Anexo 7 de la RMF 2026). Los servicios de hospitales y laboratorios privados no entran en la exención de los médicos.
  • Si no eres médico cirujano, revisa tu caso antes de facturar sin IVA: la ley habla de servicios que requieren título de médico, y dentistas, psicólogos y otras profesiones de la salud no aparecen nombrados en ella.

La otra cara de la exención: el IVA que pagas en tus gastos (renta del consultorio, material, equipo) no lo puedes restar, porque solo se acredita el IVA de gastos ligados a actividades por las que sí se paga IVA (Ley del IVA, art. 5, fr. I). Es un costo más del consultorio.

Qué lleva tu factura de honorarios médicos

  • Tus datos y los del paciente: RFC, nombre y código postal, tal como vienen en su constancia de situación fiscal.
  • La descripción del servicio: consulta, procedimiento, honorarios por cirugía.
  • El IVA como exento.
  • Si cobras a una persona moral, la retención de ISR que te hará.
  • El uso de la factura que elija el paciente. Para que pueda deducirla en su declaración anual debe pedir el uso D01, «Honorarios médicos, dentales y gastos hospitalarios» (SAT, deducciones personales de gastos médicos).

A los pacientes que no te piden factura los incluyes en una factura global al público en general: mensual si estás en RESICO, y diaria, semanal o mensual si estás en el 612 (regla 2.7.1.21 de la RMF 2026).

Un mes de una médica, resuelto con números

Pongamos una ginecóloga en RESICO. En octubre cobra $40,000 de consultas a pacientes particulares y $20,000 a una empresa con la que tiene convenio para atender a sus empleados.

Concepto Importe
Ingresos cobrados en el mes $60,000.00
Tasa RESICO (tramo hasta $83,333.33) 1.50 %
ISR del mes $900.00
Menos retención del 1.25 % de la empresa ($20,000 × 1.25 %) −$250.00
ISR a pagar $650.00
IVA $0: consultas exentas

Si la misma médica estuviera en el régimen 612, la empresa le retendría el 10 % ($2,000) y su ISR se calcularía sobre la utilidad acumulada del año con la tarifa del Anexo 8; lo explicamos en pagos provisionales de personas físicas. Para comparar los dos regímenes con tus cifras, lee la guía del RESICO.

Lo que necesita tu paciente para deducir tu consulta

Tus honorarios son deducción personal para tu paciente en su declaración anual, con tres condiciones (Ley del ISR, art. 151, fr. I):

  1. Que pague con transferencia, tarjeta de crédito o débito, o cheque nominativo desde una cuenta a su nombre. En efectivo no se deduce.
  2. Que tenga la factura con el uso D01.
  3. Que el médico tenga título profesional registrado.

En la práctica, un consultorio que cobra con terminal o transferencia y factura en el momento le ahorra dinero a su paciente. Es un argumento que vale la pena decir en recepción.

Por qué la contabilidad de un médico es distinta

Combina cosas que no se dan juntas en otros profesionistas: ingresos exentos de IVA, cobros de particulares que no siempre piden factura, pagos de aseguradoras y empresas con retenciones, y gastos con IVA que no se recupera. Alberto Ramón García, que firma este artículo, fue gerente de contabilidad y director de Administración y Finanzas en dos instituciones de seguros especializadas en salud: conoce el lado de quien te paga los honorarios.

Para médicos, dentistas y otros profesionistas de la salud, nuestra iguala es de $1,500 más IVA al mes sin nómina, o $3,000 si tienes asistente o recepcionista. Incluye tus declaraciones mensuales, el previo de tus impuestos el día 25, la renovación de tu e.firma y hasta 10 facturas y complementos de pago al mes. Tú nos mandas un Excel con los movimientos de tu banco; tus facturas las descargamos nosotros del SAT. Revisa qué más incluye en cuánto cobra un contador.

¿Tienes consultorio y no sabes si estás en el régimen correcto? Pide tu diagnóstico sin costo: con tus últimos tres meses te decimos cuánto pagarías en RESICO y en el 612.

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